这一阶段的时间较长，记载较多，大家也比较了解，只做简单介绍。此时由于从明末开始为了在残存的灵气稀薄的世界中生存，原本各自清高的道门和修真家族开始相互靠拢互帮互助，陆续组成了多种联合团体，努力维系着稀少的修真资源和传承。其中影响力最大，维持时间最长的是道盟。直到四百年前，它才彻底收归灵修部管理，名存实亡。而在历史演化的过程中，无数像腾云门这样曾经辉煌的门派，也逐渐衰败。有的干脆消失于无。相关证物一，……”
“第四阶段，天蛊宣州福泽有限公司成立，灵修研究蓬勃发展。这一阶段的关键是宣州福泽的创始人，也是灵修研究所的创始人和《科学修真法》的发明者秦何弦。她对于灵修部的成立也贡献颇深。现代人类熟悉的几乎所有生活方式，都离不开她。根据考证，秦何弦本身最初也是一个天蛊的受害者。但神奇的是，她没有任何修真资源和背景渊源，也没有任何信息来源的她竟然察觉到天蛊的存在。目前推断，她本人可能经历了和郑闲君一样的穿越经历，甚至是穿越到了同一个地方……”声音持续讲述着，一直讲到秦何弦是如何召集灵修部的所有人，并从其中精准地找到所有被甲虫天蛊寄生的宿主，后续又是如何利用这些天蛊和卢元抓到了天母，将困扰人类近千年的外来入侵生物问题彻底解决。
“之后，秦何弦走遍大江南北，找出了所有鲁文林埋下的石碑，将排灵阵法破坏。灵气开始逐渐地重新回到地球上，灵气枯竭期结束。第四阶段也至此结束。之后，秦何弦留下一本完整的《科学修真法》和应对天蛊的方法，就再也没有出现过，距今已有近六百年。普遍认为，她的修为攀升极快，很可能已修炼至大圆满。关于秦何弦本人的卷宗，请查阅绝密级文档……”
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