所作的许多不法之事。在他看，最恶毒的是，以为皇帝因为他的'奉职无状';而'宵旰忧劳';，当此春阳燥暖之际，亦不得安然怡养。这一挑拨，如果忽视，则圣眷一衰，真的可能有不测之祸。
于是，当天他就上了个奏请开缺的折子。皇帝胸有成竹，降旨慰留，预期着张佩纶必不罢休，要看他第二个折子，说些什么？
张佩纶的第二个折子，对王文韶展开正面的攻击，措词运用，却另有巧妙。共是一折一片，折子上说他才具不胜，如果皇帝据以罢斥，则发抄原折，可以不提报销案的弊端，对王文韶还算是顾面子。但要说服皇帝，则又非提报销案的弊端不可，因而加一个附片，指出两省报销案三可疑：第一疑："王文韶曾在云南司派办处行走，报销之弊，当所稔知。此案既致人言，必有书吏在内，若于奉旨之日，即密饬司员将承办书吏，羁管候传，抑或押送刑部，岂不光明磊落，群疑尽释？乃谳传函牍屡传，机事不密，任令远扬，归过司员，全无作色。人或曰：文韶机警，何独于书吏则不机警？"
第二疑："此案报销，将岁支杂款，全行纳入军需，本非常科，即疆吏声叙在先，亦宜奏驳，既已含混复准，经言者论劾，若户部即请简派大臣复核，则过出无心，犹可共谅。乃至户部堂官奏请复核，始与景廉面恳回避。风闻银数出入，散总不甚相符，且事先迅催兵工两部，不及候复，率先奏结，尤为情弊显然。人或曰：文韶精密，何独于报销则不精密？"
第三疑："崔尊彝、潘英章为此案罪魁祸首，既据商人供称：汇款系为报销。状证确凿，该两员即属有玷官箴。周瑞清已经解任，该两员不先革职，亦当暂行开缺，乃迭降明谕，但曰：'严催解送';。他枢臣即未见及，王文韶若欲自明，何以默不一语？人或曰：文韶明白，何独于该两员处分则不明白？"
张佩纶真不愧是清流中的健笔，字里行间的指责，皇帝当然看得出来，第二疑暂且不论，第一疑指王文韶故意放书办逃走，意在消灭罪证。第三疑是指王文韶包庇崔尊彝、潘英章。衡情度理，确有可疑。
因此，持着这一折一片，皇帝便开始认真考虑让王文韶走路。继任人选，倒是早就想好了的，此刻还要考虑的是，张佩纶分析事理，精到细致，不光是会骂人、会说大话。然则该当如何重用？思考未定，便只有暂且搁置，于是王文韶第二次上折辞官，又蒙慰留。但语气跟前不同了，说"览其所奏各情，本应俯如所请。不过军机处及总理各国事务办事需人，王文韶尚称熟悉，着仍遵前旨，于假满后照常入直。"
这'尚称熟悉';四个字，是军机章京看风头所下的贬词，经抱病复起的奕